Según el principio de devengo, toda factura se debe declarar en el momento de su emisión, indiferentemente de la fecha de cobro o pago de la misma. Más información aquí.

Así que puedes subir y deducir la factura sin problema, asegúrate que aparezcan todos tus datos fiscales para poderla deducir correctamente (DNI, nombre y domicilio).